Esto pasa cuando se usa un Framework de .NET inferior al 2.0. Hay que instalar el nuevo, si no está instalado ya, y decirle a la aplicación que queremos usar el nuevo. Se puede hacer tocando el registro directamente o con una aplicación que se llama VersionSwitcher:
http://www.denisbauer.com/NETTools/ASPNETVersionSwitcher.aspx