Para saber la codificación de un fichero y el modo de final de línea debemos ejecutar el comando:
file nombreFichero
Por ejemplo, esto:
file web/valladolid/wp-includes/csv/k9code.php
Devolvería esta salida:
web/valladolid/wp-includes/csv/k9code.php: PHP script, ISO-8859 text, with CRLF line terminators